Pokémon también cuenta con su propia aplicación de móviles, procedente del videojuego lanzado inicialmente de manera gratuita en 3DS, Shuffle. Después de cosechar un gran éxito, y de actualizarse con eventos prácticamente de forma diaria, por fin se han añadido nuevos modos de juego.
En este parche podremos probar nuevas posibilidades como cartas de misión, al mismo estilo de mundo misterioso, tendremos que superar unos retos para obtener una recompensa. También han incorporado un modo de supervivencia, teniendo que elegir un equipo pokémon y superar una serie de criaturas, al estilo de un combate pokémon.
En cuanto a la accesibilidad, por fin podemos agregar amigos por el nombre de usuario, no teniendo que ir a Facebook, además de la interfaz gráfica. Finalmente si adquieres joyas comprándolas, tendrás diversas recompensas como vidas o mejores bonificaciones.